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So. Ich bin zum Schluss doch noch selbst auf die Lösung gekommen. Eigentlich ganz einfach. Mein Fehler war, dass ich bei CLASSPATH nur an das Betriebssystem gedacht habe. Allerdings müssen die license-Jar’s nicht oder nicht nur dort veröffentlich werden sondern (auch) als JDBC-Provider im Classpath/Enviroment innerhalb von WebSphere beim jeweiligen Applicationserver hinzugfügt werden.

IBM WebSphere Application Server Administrationsconsole:
-Resources
-JDBC Providers > DB2 Universal JDBC Driver Provider
-Classpath:
${DB2UNIVERSAL_JDBC_DRIVER_PATH}/db2jcc.jar
${DB2UNIVERSAL_JDBC_DRIVER_PATH}/db2jcc_license_cu.jar
${DB2UNIVERSAL_JDBC_DRIVER_PATH}/db2jcc_license_cisuz.jar

Das war’s schon.
(nicht ganz, ich habe sicherheitshalber noch die db2jcct2.dll hinzugefügt)